「q-bio.BM」カテゴリーアーカイブ

ApisTox: a new benchmark dataset for the classification of small molecules toxicity on honey bees

投稿日: 2024年12月2日 作成者: jarxiv

要約 ミツバチの個体数の世界的な減少は、農業、生物多様性、環境の安定性に重大なリ … 続きを読む →

カテゴリー: 92-04, cs.AI, cs.LG, J.3, q-bio.BM, q-bio.QM | ApisTox: a new benchmark dataset for the classification of small molecules toxicity on honey bees はコメントを受け付けていません

Orientation-Aware Graph Neural Networks for Protein Structure Representation Learning

投稿日: 2024年11月27日 作成者: jarxiv

要約 タンパク質は、特定の 3D 構造に折りたたまれることにより、生物において重 … 続きを読む →

カテゴリー: cs.AI, cs.LG, q-bio.BM | Orientation-Aware Graph Neural Networks for Protein Structure Representation Learning はコメントを受け付けていません

A Multi-Grained Symmetric Differential Equation Model for Learning Protein-Ligand Binding Dynamics

投稿日: 2024年11月27日 作成者: jarxiv

要約 創薬において、タンパク質とリガンドの結合に関する分子動力学 (MD) シミ … 続きを読む →

カテゴリー: cs.AI, cs.LG, q-bio.BM, q-bio.QM, stat.ML | A Multi-Grained Symmetric Differential Equation Model for Learning Protein-Ligand Binding Dynamics はコメントを受け付けていません

Exploring Discrete Flow Matching for 3D De Novo Molecule Generation

投稿日: 2024年11月26日 作成者: jarxiv

要約 新しい分子構造を生成する深層生成モデルは、化学的発見を促進する可能性を秘め … 続きを読む →

カテゴリー: cs.LG, q-bio.BM | Exploring Discrete Flow Matching for 3D De Novo Molecule Generation はコメントを受け付けていません

Structure-Based Molecule Optimization via Gradient-Guided Bayesian Update

投稿日: 2024年11月22日 作成者: jarxiv

要約 構造ベース分子最適化 (SBMO) は、タンパク質標的に対して連続座標と離 … 続きを読む →

カテゴリー: cs.AI, q-bio.BM | Structure-Based Molecule Optimization via Gradient-Guided Bayesian Update はコメントを受け付けていません

Unlocking the Power of Gradient Guidance for Structure-Based Molecule Optimization

投稿日: 2024年11月21日 作成者: jarxiv

要約 構造ベース分子最適化 (SBMO) は、タンパク質標的に対して連続座標と離 … 続きを読む →

カテゴリー: cs.AI, q-bio.BM | Unlocking the Power of Gradient Guidance for Structure-Based Molecule Optimization はコメントを受け付けていません

GNNAS-Dock: Budget Aware Algorithm Selection with Graph Neural Networks for Molecular Docking

投稿日: 2024年11月20日 作成者: jarxiv

要約 分子ドッキングは創薬と設計における主要な要素です。 小分子のタンパク質への … 続きを読む →

カテゴリー: cs.LG, q-bio.BM | GNNAS-Dock: Budget Aware Algorithm Selection with Graph Neural Networks for Molecular Docking はコメントを受け付けていません

log-RRIM: Yield Prediction via Local-to-global Reaction Representation Learning and Interaction Modeling

投稿日: 2024年11月20日 作成者: jarxiv

要約 化学反応の収率を正確に予測することは、有機合成を最適化するために非常に重要 … 続きを読む →

カテゴリー: cs.AI, cs.LG, q-bio.BM | log-RRIM: Yield Prediction via Local-to-global Reaction Representation Learning and Interaction Modeling はコメントを受け付けていません

Hierarchical Structure Enhances the Convergence and Generalizability of Linear Molecular Representation

投稿日: 2024年11月19日 作成者: jarxiv

要約 言語モデルは、構文、意味論、および推論における基本的な能力を示しますが、そ … 続きを読む →

カテゴリー: cs.AI, q-bio.BM | Hierarchical Structure Enhances the Convergence and Generalizability of Linear Molecular Representation はコメントを受け付けていません

RiNALMo: General-Purpose RNA Language Models Can Generalize Well on Structure Prediction Tasks

投稿日: 2024年11月13日 作成者: jarxiv

要約 RNA は最近、興味深い低分子薬剤標的として認識されていますが、それを最大 … 続きを読む →

カテゴリー: cs.LG, q-bio.BM | RiNALMo: General-Purpose RNA Language Models Can Generalize Well on Structure Prediction Tasks はコメントを受け付けていません