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「q-bio.BM」カテゴリーアーカイブ
AlphaFold Meets Flow Matching for Generating Protein Ensembles
要約 タンパク質の生物学的機能は、しばしば動的な構造アンサンブルに依存している。 … 続きを読む
Force-Guided Bridge Matching for Full-Atom Time-Coarsened Dynamics of Peptides
要約 分子動力学(MD)シミュレーションは、材料科学、化学、薬理学などの分野にお … 続きを読む
カテゴリー: cs.LG, physics.chem-ph, physics.comp-ph, q-bio.BM
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Force-Guided Bridge Matching for Full-Atom Time-Coarsened Dynamics of Peptides
要約 分子動力学 (MD) シミュレーションは、ほんの数例を挙げると、材料科学、 … 続きを読む
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Dynamic PDB: A New Dataset and a SE(3) Model Extension by Integrating Dynamic Behaviors and Physical Properties in Protein Structures
要約 タンパク質の静的構造の収集と予測は大幅に進歩しているにもかかわらず、最も重 … 続きを読む
LipidBERT: A Lipid Language Model Pre-trained on METiS de novo Lipid Library
要約 この研究では、METiS の社内の de novo 脂質生成アルゴリズムと … 続きを読む
カテゴリー: cs.CL, physics.chem-ph, q-bio.BM
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Molecular Graph Representation Learning Integrating Large Language Models with Domain-specific Small Models
要約 分子特性の予測は創薬の重要な基盤です。 近年、事前トレーニングされた深層学 … 続きを読む
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LipidBERT: A Lipid Language Model Pre-trained on METiS de novo Lipid Library
要約 この研究では、METiS の社内の de novo 脂質生成アルゴリズムと … 続きを読む
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Open-Source Molecular Processing Pipeline for Generating Molecules
要約 分子の生成モデルは、計算化学での使用がかなり有望であることが示されています … 続きを読む
CREMP: Conformer-rotamer ensembles of macrocyclic peptides for machine learning
要約 大環状ペプチドの立体構造をモデル化するための計算および機械学習のアプローチ … 続きを読む
カテゴリー: cs.LG, physics.chem-ph, q-bio.BM
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Cell Morphology-Guided Small Molecule Generation with GFlowNets
要約 ハイコンテントイメージング（HCI）を含むハイコンテント表現型スクリーニン … 続きを読む