「q-bio.BM」カテゴリーアーカイブ

COMET: Benchmark for Comprehensive Biological Multi-omics Evaluation Tasks and Language Models

投稿日: 2024年12月16日 作成者: jarxiv

要約 セントラル ドグマ内の重要な要素として、DNA、RNA、タンパク質は、正確 … 続きを読む →

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Sequence-Augmented SE(3)-Flow Matching For Conditional Protein Backbone Generation

投稿日: 2024年12月12日 作成者: jarxiv

要約 タンパク質はほぼすべての生物学的プロセスに不可欠であり、その多様な機能は複 … 続きを読む →

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Bayesian Optimization of Antibodies Informed by a Generative Model of Evolving Sequences

投稿日: 2024年12月11日 作成者: jarxiv

要約 効果的な治療薬を構築するために、生物学者は抗体の配列を繰り返し変異させて結 … 続きを読む →

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Deep-Learning Based Docking Methods: Fair Comparisons to Conventional Docking Workflows

投稿日: 2024年12月10日 作成者: jarxiv

要約 低分子リガンドをタンパク質結合部位にドッキングするための拡散学習法である … 続きを読む →

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ProtFAD: Introducing function-aware domains as implicit modality towards protein function prediction

投稿日: 2024年12月3日 作成者: jarxiv

要約 タンパク質の機能予測は現在、その配列または構造をエンコードすることによって … 続きを読む →

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ApisTox: a new benchmark dataset for the classification of small molecules toxicity on honey bees

投稿日: 2024年12月2日 作成者: jarxiv

要約 ミツバチの個体数の世界的な減少は、農業、生物多様性、環境の安定性に重大なリ … 続きを読む →

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Orientation-Aware Graph Neural Networks for Protein Structure Representation Learning

投稿日: 2024年11月27日 作成者: jarxiv

要約 タンパク質は、特定の 3D 構造に折りたたまれることにより、生物において重 … 続きを読む →

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A Multi-Grained Symmetric Differential Equation Model for Learning Protein-Ligand Binding Dynamics

投稿日: 2024年11月27日 作成者: jarxiv

要約 創薬において、タンパク質とリガンドの結合に関する分子動力学 (MD) シミ … 続きを読む →

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Exploring Discrete Flow Matching for 3D De Novo Molecule Generation

投稿日: 2024年11月26日 作成者: jarxiv

要約 新しい分子構造を生成する深層生成モデルは、化学的発見を促進する可能性を秘め … 続きを読む →

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Structure-Based Molecule Optimization via Gradient-Guided Bayesian Update

投稿日: 2024年11月22日 作成者: jarxiv

要約 構造ベース分子最適化 (SBMO) は、タンパク質標的に対して連続座標と離 … 続きを読む →

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