metasnf: Meta Clustering with Similarity Network Fusion in R

要約

metasnf は、メタ クラスタリング (ソリューション自体をクラスタリングすることでクラスタ ソリューションの広範囲を効率的に検索する方法) を、類似性ネットワーク フュージョン (SNF) に基づくクラスタリング ワークフローに適用できるようにする R パッケージです。
SNF は、生物医学的なサブタイプの発見に一般的に使用されるマルチモーダル データ統合アルゴリズムです。
このパッケージには、クラスターの視覚化、特性評価、および検証を支援する機能も含まれています。
このパッケージは、研究者が、コンテキストに依存しない品質の尺度ではなく、コンテキスト固有のユーティリティによって導かれる SNF 由来のクラスター ソリューションを特定するのに役立ちます。

要約(オリジナル)

metasnf is an R package that enables users to apply meta clustering, a method for efficiently searching a broad space of cluster solutions by clustering the solutions themselves, to clustering workflows based on similarity network fusion (SNF). SNF is a multi-modal data integration algorithm commonly used for biomedical subtype discovery. The package also contains functions to assist with cluster visualization, characterization, and validation. This package can help researchers identify SNF-derived cluster solutions that are guided by context-specific utility over context-agnostic measures of quality.

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