Of Mice and Mates: Automated Classification and Modelling of Mouse Behaviour in Groups using a Single Model across Cages

要約

行動実験は特殊な環境で行われることが多いのですが、そのことが解析の妨げになることがあります。この問題に対処するため、私たちはホームケージ環境でマウスを研究するためのツールを提供し、生物学者に個体の行動の時間的側面を捉え、最小限の人間の介入でケージメイト間の相互作用と相互依存をモデル化する可能性を装備します。私たちは、動画からマウスの行動を自動的に分類するアクティビティラベリングモジュール（ALM）と、ケージ間の共同行動を要約する新しいグループ行動モデル（GBM）を開発し、順列行列を使用して各ケージのマウスのアイデンティティをモデルに適合させています。また、行動分類器のトレーニング用ABODeと行動モデル化用IMADGEの2つのデータセットも公開しています。

要約(オリジナル)

Behavioural experiments often happen in specialised arenas, but this may confound the analysis. To address this issue, we provide tools to study mice in the homecage environment, equipping biologists with the possibility to capture the temporal aspect of the individual’s behaviour and model the interaction and interdependence between cage-mates with minimal human intervention. We develop the Activity Labelling Module (ALM) to automatically classify mouse behaviour from video, and a novel Group Behaviour Model (GBM) for summarising their joint behaviour across cages, using a permutation matrix to match the mouse identities in each cage to the model. We also release two datasets, ABODe for training behaviour classifiers and IMADGE for modelling behaviour.

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arxiv.jp, DeepL