A Novel Pathology Foundation Model by Mayo Clinic, Charité, and Aignostics

要約

デジタルパソロジーの最近の進歩により、さまざまなアプリケーションにわたる基礎モデルの有効性が実証されました。
このレポートでは、RudolfV アプローチに基づいた新しい視覚基盤モデルを紹介します。
私たちのモデルは、メイヨー クリニックとベルリン大学の 2 つの医療機関から収集された 120 万枚の病理組織スライド画像全体で構成されるデータセットでトレーニングされました。
包括的な評価では、パラメーター数やトレーニング データセット サイズの点で最大のモデルではないにもかかわらず、このモデルが 21 の公開ベンチマーク データセットにわたって最先端のパフォーマンスを達成していることがわかりました。

要約(オリジナル)

Recent advances in digital pathology have demonstrated the effectiveness of foundation models across diverse applications. In this report, we present a novel vision foundation model based on the RudolfV approach. Our model was trained on a dataset comprising 1.2 million histopathology whole slide images, collected from two medical institutions: Mayo Clinic and Charit\’e – Universt\’atsmedizin Berlin. Comprehensive evaluations show that our model achieves state-of-the-art performance across twenty-one public benchmark datasets, even though it is neither the largest model by parameter count nor by training dataset size.

arxiv情報

著者 Maximilian Alber,Stephan Tietz,Jonas Dippel,Timo Milbich,Timothée Lesort,Panos Korfiatis,Moritz Krügener,Beatriz Perez Cancer,Neelay Shah,Alexander Möllers,Philipp Seegerer,Alexandra Carpen-Amarie,Kai Standvoss,Gabriel Dernbach,Edwin de Jong,Simon Schallenberg,Andreas Kunft,Helmut Hoffer von Ankershoffen,Gavin Schaeferle,Patrick Duffy,Matt Redlon,Philipp Jurmeister,David Horst,Lukas Ruff,Klaus-Robert Müller,Frederick Klauschen,Andrew Norgan
発行日 2025-01-09 18:06:45+00:00
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