ApisTox: a new benchmark dataset for the classification of small molecules toxicity on honey bees

要約

ミツバチの個体数の世界的な減少は、農業、生物多様性、環境の安定性に重大なリスクをもたらします。
既存のデータのギャップを埋めるために、ミツバチ (Apis mellifera) に対する農薬の毒性に焦点を当てた包括的なデータセットである ApisTox を紹介します。
このデータセットは、ECOTOX や PPDB などの既存のソースからのデータを組み合わせて活用し、以前のデータセットを超える広範で一貫性のある精選されたコレクションを提供します。
ApisTox には、化学物質の毒性レベル、文献掲載時期などの詳細、外部化学データベースにリンクする識別子など、幅広いデータが組み込まれています。
このデータセットは、環境および農業研究の重要なツールとして機能する可能性がありますが、ミツバチの個体数への害を最小限に抑えることを目的とした政策や実践の開発をサポートすることもできます。
最後に、ApisTox は、農薬化合物の分子特性予測方法のベンチマークを行うための独自のリソースを提供し、環境科学と化学情報学の両方の進歩を促進します。
このため、学術研究とミツバチの保護における実際の応用の両方にとって貴重なツールとなります。

要約(オリジナル)

The global decline in bee populations poses significant risks to agriculture, biodiversity, and environmental stability. To bridge the gap in existing data, we introduce ApisTox, a comprehensive dataset focusing on the toxicity of pesticides to honey bees (Apis mellifera). This dataset combines and leverages data from existing sources such as ECOTOX and PPDB, providing an extensive, consistent, and curated collection that surpasses the previous datasets. ApisTox incorporates a wide array of data, including toxicity levels for chemicals, details such as time of their publication in literature, and identifiers linking them to external chemical databases. This dataset may serve as an important tool for environmental and agricultural research, but also can support the development of policies and practices aimed at minimizing harm to bee populations. Finally, ApisTox offers a unique resource for benchmarking molecular property prediction methods on agrochemical compounds, facilitating advancements in both environmental science and cheminformatics. This makes it a valuable tool for both academic research and practical applications in bee conservation.

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