GenoCraft: A Comprehensive, User-Friendly Web-Based Platform for High-Throughput Omics Data Analysis and Visualization

要約

ハイスループットのオミクスデータの急増により生物学研究の状況は一変し、強力で使いやすいデータ分析および解釈ツールの必要性が強調されています。
この論文では、オミックス データ処理のパイプライン全体を処理するように設計された Web ベースの包括的なソフトウェア ソリューションである GenoCraft について説明します。
GenoCraft は、オミックス データ分析のあらゆる側面をカバーする、高度なバイオインフォマティクス ツールを備えた統合プラットフォームを提供します。
これには、正規化、品質管理、差分分析、ネットワーク分析、パスウェイ分析、さまざまな視覚化技術など、さまざまな機能が含まれています。
このソフトウェアにより、最先端のオミクスデータ解析をより幅広いユーザーが利用できるようになります。
GenoCraft を使用すると、研究者やデータ サイエンティストは、使いやすいインターフェイスで一連の最先端のバイオインフォマティクス ツールにアクセスできるため、大規模なオミクス データを管理および分析するための貴重なリソースになります。
インタラクティブな Web インターフェイスを備えた API は、https://genocraft.stanford で公開されています。
エデュ/。
また、すべてのコードを https://github.com/futianfan/GenoCraft でリリースします。

要約(オリジナル)

The surge in high-throughput omics data has reshaped the landscape of biological research, underlining the need for powerful, user-friendly data analysis and interpretation tools. This paper presents GenoCraft, a web-based comprehensive software solution designed to handle the entire pipeline of omics data processing. GenoCraft offers a unified platform featuring advanced bioinformatics tools, covering all aspects of omics data analysis. It encompasses a range of functionalities, such as normalization, quality control, differential analysis, network analysis, pathway analysis, and diverse visualization techniques. This software makes state-of-the-art omics data analysis more accessible to a wider range of users. With GenoCraft, researchers and data scientists have access to an array of cutting-edge bioinformatics tools under a user-friendly interface, making it a valuable resource for managing and analyzing large-scale omics data. The API with an interactive web interface is publicly available at https://genocraft.stanford. edu/. We also release all the codes in https://github.com/futianfan/GenoCraft.

arxiv情報

著者 Yingzhou Lu,Minjie Shen,Ling Yue,Chenhao Li,Fan Meng,Xiao Wang,David Herrington,Yue Wang,Yue Zhao,Tianfan Fu,Capucine Van Rechem
発行日 2024-09-04 17:04:40+00:00
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