HelixFold-Multimer: Elevating Protein Complex Structure Prediction to New Heights

要約

モノマータンパク質の構造予測ツールは優れた精度を誇っていますが、タンパク質の複合構造の予測は依然としてこの分野で困難な課題です。
この課題は、抗原抗体相互作用など、異なる種のタンパク質鎖との複合体が関与するシナリオで特に顕著であり、精度が不十分なことがよくあります。
複雑な予測の精度によって制限されるため、正確なタンパク質間相互作用分析に基づくタスクも障害に直面します。
このレポートでは、タンパク質複合体構造予測モデル HelixFold-Multimer の継続的な進歩に焦点を当て、その性能の向上を強調します。
HelixFold-Multimer は、特に治療用タンパク質相互作用において、多様なタンパク質複合体構造を正確に予測します。
特に、HelixFold-Multimer は抗原抗体およびペプチドタンパク質の構造予測において目覚ましい成功を収めており、AlphaFold 3 を大きく上回っています。HelixFold-Multimer は現在、PaddleHelix プラットフォームで一般公開されており、一般バージョンと抗原抗体バージョンの両方が提供されています。
研究者は、開発ニーズに合わせてこのサービスに簡単にアクセスして利用できます。

要約(オリジナル)

While monomer protein structure prediction tools boast impressive accuracy, the prediction of protein complex structures remains a daunting challenge in the field. This challenge is particularly pronounced in scenarios involving complexes with protein chains from different species, such as antigen-antibody interactions, where accuracy often falls short. Limited by the accuracy of complex prediction, tasks based on precise protein-protein interaction analysis also face obstacles. In this report, we highlight the ongoing advancements of our protein complex structure prediction model, HelixFold-Multimer, underscoring its enhanced performance. HelixFold-Multimer provides precise predictions for diverse protein complex structures, especially in therapeutic protein interactions. Notably, HelixFold-Multimer achieves remarkable success in antigen-antibody and peptide-protein structure prediction, greatly surpassing AlphaFold 3. HelixFold-Multimer is now available for public use on the PaddleHelix platform, offering both a general version and an antigen-antibody version. Researchers can conveniently access and utilize this service for their development needs.

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