3D-based RNA function prediction tools in rnaglib

要約

RNA の複雑な構造的特徴と生物学的機能との関係を理解することは、進化研究および RNA 設計における基本的な課題です。
しかし、RNA 3D 構造のデータセットを構築し、適切なモデリングを選択するには依然として時間がかかり、標準化が不足しています。
この章では、RNA 3D 構造のデータセット上で教師ありおよび教師なしの機械学習ベースの関数予測モデルをトレーニングするための rnaglib の使用について説明します。

要約(オリジナル)

Understanding the connection between complex structural features of RNA and biological function is a fundamental challenge in evolutionary studies and in RNA design. However, building datasets of RNA 3D structures and making appropriate modeling choices remains time-consuming and lacks standardization. In this chapter, we describe the use of rnaglib, to train supervised and unsupervised machine learning-based function prediction models on datasets of RNA 3D structures.

arxiv情報

提供元, 利用サービス

arxiv.jp, Google