EndoMapper dataset of complete calibrated endoscopy procedures

要約

コンピュータ支援システムは医療分野で広く使用されるようになってきています。
内視鏡検査では、ほとんどの研究がポリープやその他の病状の自動検出に焦点を当てていますが、内視鏡の位置特定とナビゲーションは医師によって完全に手動で行われます。
この研究を拡大し、内視鏡検査に空間人工知能を導入するには、完全な手順からのデータが必要です。
本稿では、医療データの二次利用を可能にする、通常の医療行為中に取得された完全な内視鏡シーケンスを初めて収集した Endomapper データセットを紹介します。
その主な目的は、実際の内視鏡データにおける Visual Simultaneous Localization and Mapping (VSLAM) メソッドの開発と評価を容易にすることです。
データセットには 24 時間以上のビデオが含まれています。
これは、内視鏡のキャリブレーションとオリジナルのキャリブレーション ビデオを含む初の内視鏡データセットです。
データセットに関連付けられたメタデータと注釈は、解剖学的ランドマーク、手順のラベル付け、セグメンテーション、再構成、グラウンド トゥルースを使用したシミュレートされたシーケンス、および同じ患者の手順などによって異なります。
この論文で使用されているソフトウェアは一般に公開されています。

要約(オリジナル)

Computer-assisted systems are becoming broadly used in medicine. In endoscopy, most research focuses on the automatic detection of polyps or other pathologies, but localization and navigation of the endoscope are completely performed manually by physicians. To broaden this research and bring spatial Artificial Intelligence to endoscopies, data from complete procedures is needed. This paper introduces the Endomapper dataset, the first collection of complete endoscopy sequences acquired during regular medical practice, making secondary use of medical data. Its main purpose is to facilitate the development and evaluation of Visual Simultaneous Localization and Mapping (VSLAM) methods in real endoscopy data. The dataset contains more than 24 hours of video. It is the first endoscopic dataset that includes endoscope calibration as well as the original calibration videos. Meta-data and annotations associated with the dataset vary from the anatomical landmarks, procedure labeling, segmentations, reconstructions, simulated sequences with ground truth and same patient procedures. The software used in this paper is publicly available.

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