要約
線虫Caenorhabditiselegans（C. elegans）は、発生生物学と神経生物学をよりよく理解するためのモデル生物として使用されます。
C. elegansは、蛍光顕微鏡画像を使用してカタログ化および観察された不変の細胞系統を特徴としています。
ただし、後期の発達段階で細胞を追跡するための確立された方法は、散発的な筋肉のけいれんが始まると一般化できません。
私たちは、皮膚細胞を基準マーカーとして使用して、ランダムなけいれんにもかかわらず細胞追跡を実行する方法論に基づいています。
特に、3DレンダリングGUIに統合された細胞核のセグメンテーションと追跡手順を紹介し、後期開発全体で細胞を追跡する効率を向上させます。
3つの試験胚にわたる前述の筋細胞核を描いた画像の結果は、古典的な追跡パラダイムと組み合わせた基準マーカーが散発的なけいれんを克服することを示唆しています。
要約(オリジナル)
The nematode Caenorhabditis elegans (C. elegans) is used as a model organism to better understand developmental biology and neurobiology. C. elegans features an invariant cell lineage, which has been catalogued and observed using fluorescence microscopy images. However, established methods to track cells in late-stage development fail to generalize once sporadic muscular twitching has begun. We build upon methodology which uses skin cells as fiducial markers to carry out cell tracking despite random twitching. In particular, we present a cell nucleus segmentation and tracking procedure which was integrated into a 3D rendering GUI to improve efficiency in tracking cells across late-stage development. Results on images depicting aforementioned muscle cell nuclei across three test embryos suggest the fiducial markers in conjunction with a classic tracking paradigm overcome sporadic twitching.
arxiv情報
| 著者 | Andrew Lauziere,Ryan Christensen,Hari Shroff |
| 発行日 | 2022-07-27 16:21:52+00:00 |
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